首次感染病毒，一般从接触到发病约2-10天，平均6天，最长达45天，也就是潜伏期。

生殖器疱疹患病部位先有烧灼感，很快在红斑基础上发生3-10个成群的红色丘疹，伴有瘙痒，丘疹很快变成小水疱，3-5天后变为脓疱，破溃后形成大片的糜烂和溃疡，自觉疼痛，最后结痂愈合。

生殖器疱疹整个病程可持续20天左右。